《生物信息學》考試大綱
一、 基本要求
掌握生物信息學常用數(shù)據(jù)庫和使用方法；掌握序列比對方法和主要比對軟件使用方法；掌握DNA序列和蛋白質序列特征分析和常用序列分析軟件包使用方法；掌握分子進化理論和常用分析方法；掌握基因功能注釋方法和常用軟件使用方法；掌握基因表達數(shù)據(jù)分析方法和常用分析軟件使用方法。
二、 考試范圍
1. 課程相關知識
基本要求：掌握生物信息學的定義、基本概念和發(fā)展；掌握生物信息學研究的基本內(nèi)容、基本原理和生物學基礎；了解計算機在生物研究中的應用；了解生物信息學發(fā)展史、開發(fā)與產(chǎn)業(yè)化。
1．生物信息學數(shù)據(jù)庫
（1）知識點1：NCBI數(shù)據(jù)庫的介紹
（2）知識點2：Swiss-Prot數(shù)據(jù)庫
（3）知識點3：PDB數(shù)據(jù)庫
基本要求： 掌握NCBI數(shù)據(jù)庫的建設和使用方法；掌握Swiss-Prot和PDB數(shù)據(jù)庫的使用方法。
2.序列比對
（1）知識點1：雙重序列比對分析
（2）知識點2：多序列比對分析
（3）知識點3：BLAST數(shù)據(jù)庫搜索
基本要求：掌握序列比對的原理和方法；掌握如何使用BLAST軟件進行數(shù)據(jù)庫搜索和同源性分析。
3.序列特征分析
（1）知識點1：DNA序列特征分析
（2）知識點2：蛋白質序列特征分析
基本要求：掌握基因預測的原理和方法；掌握啟動子區(qū)域預測和分析的原理和方法；掌握蛋白質序列跨膜區(qū)分析的原理和方法。
4.分子進化分析
（1）知識點1：系統(tǒng)發(fā)育樹的概念
（2）知識點2：分子進化理論
（3）知識點3：系統(tǒng)發(fā)育樹的構建
基本要求：掌握系統(tǒng)發(fā)育樹的概念；掌握DNA和蛋白質序列適應性進化的分子理論；掌握系統(tǒng)發(fā)育樹構建的原理和方法。
5. 基因功能注釋
（1）知識點1：基因功能的基本概念
（2）知識點2：基因功能的注釋原理和方法
基本要求：掌握基因注釋和功能分類的基本概念；掌握基因功能注釋的原理和方法；掌握常用基因功能注釋軟件的使用；
6.基因表達數(shù)據(jù)分析
（1）知識點1：基因表達數(shù)據(jù)獲取的生物學技術平臺
（2）知識點2：基因表達數(shù)據(jù)分析
基本要求：掌握基因表達技術的主要生物學平臺；掌握基因表達數(shù)據(jù)的主要分析方法和原理；掌握基因表達數(shù)據(jù)分析常用軟件的使用。
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